Unter dem Aspekt der natürlichen Potenziale und Werte stellt das Gebiet der Gemeinde Mojkovac ein spezifisches Gebiet dar, wenn man bedenkt, dass sich auf dem Territorium ihrer Gemeinde der Nationalpark Biogradska Gora, der Durmitor-Nationalpark sowie das Einzugsgebiet des Flusses Tara erstreckt, ein internationales Naturschutzgebiet, das 1977 unter den Schutz der UNESCO gestellt wurde (im Rahmen des Programms "M&B" – "Der Mensch und die Biosphäre"). Auf dem Territorium der Gemeinde Mojkovac wurde ein Naturschutzgebiet registriert, nämlich das Gebiet Crna poda (Fläche von 80 Hektar, innerhalb des Nationalparks "Durmitor"), als Schwarzkiefernreservat, am Anfang des Schluchtentals des Flusses Tara, in der Nähe der Siedlung Bistrica.
Das Gebiet des Nationalparks Biogradska Gora umfasst Teile des Territoriums der Gemeinden Kolašin, Mojkovac, Berane und Andrijevica. Der Nationalpark erstreckt sich über eine Fläche von 5.650 Hektar, davon 370 ha in der Gemeinde Mojkovac.
Die Grenze des Nationalparks in Mojkovac beginnt am Fluss Tara bei der Kote 832, über die Jarčeve strane (Seiten des Steinbocks) kommt man zum Polygon 2032 und von dort bis zur Kote 2005. Die Grenze wendet sich dann in Richtung Osten und bricht auf den Bergrücken über dem Šiško-See aus, biegt in dem Bogen ab und bricht auf dem Höhepunkt 1907 in die Velika Ostrovica aus, umfasst Veliki Ursulovac auf der Crna Glava die Kote 2137. Von dort aus setzt sich die Grenze in westlicher Richtung auf die Kote 1898 fort, nach Troglav, geht dann bis Katun Vranjak – die Kote 1787, wendet sich nach Nordwesten auf die Kote 1890, Katun Goleš und Crvena greda, geht weiter zur Unteren Lumer-Kote 1728 und steigt zum Lumer-Bach ab. Dann führt die Grenze weiter bis zur Mündung des Lumerbaches in die Tara, biegt in Richtung Norden ab und verläuft am linken Ufer des Tara-Flusses entlang bis zum Ausgangspunkt.
Die Fläche des Nationalparks "Durmitor" umfasst heute eine Fläche von 33.895 Hektar (laut PPPPN Nationalpark "Durmitor"), wovon sich ca. 3000 Hektar des Nationalparks in der Gemeinde Mojkovac befinden. Mit der Verabschiedung des Gesetzes über die Nationalparks aus den Jahren 1978, 1991 und 1994 ("Amtsblatt der RCG", Nr. 27/94) wurden die Grenzen, die Verwaltung des Parks, besondere Schutzzonen und Maßnahmen zur Regulierung und Verbesserung der natürlichen Ressourcen festgelegt. Die Grenze des Nationalparks "Durmitor" auf dem Gebiet der Gemeinde Mojkovac stellt gleichzeitig die Grenze des Einzugsgebiets des Flusses Tara dar. Innerhalb des Nationalparks "Durmitor" stechen folgende natürliche Ressourcen hervor, bewahrte einheimische Werte: die Stätte "Crna poda", die engste Umgebung des Zabojsko-Sees als besonderes Naturschutzgebiet, Manastirska vrela und der Wasserfall Skok in Dobrilovina, als hydrographisches und hydrologisches Naturdenkmal, die Höhlen Škola und Šalintrača in Dobrilovina als Denkmal der Natur, sowie geomorphologische Werte in der Schutzzone des Parks (Berggipfel des Prošćenje-Gebirges – Sveviđe, Ljeljeni vrh, Konjska lastva, usw.). Neben den erwähnten hydrologischen, geomorphologischen und speläologischen Naturwerten gibt es auf dem Gebiet des Nationalparks Lebensräume einer Vielzahl geschützter Pflanzen- und Tierarten (von denen viele von regionaler und internationaler Bedeutung sind) sowie einzelne Exemplare von Endemie-, Relikt- und endemisch-reliktfloristischen Exemplaren.
Ein besonderes natürliches, biologisches, ökologisches und hydrologisches Phänomen in der Gemeinde Mojkovac ist der Fluss Tara mit seinem Flusseinzugsgebiet.
Das Gebiet des Sinjajevina-Gebirges in der Gemeinde Mojkovac stellt ein Gebiet mit außergewöhnlichem touristischem Potenzial dar, das auf der Erhaltung natürlicher und ökologischer Eigenschaften basiert, vor allem aufgrund der extremen Unbewohntheit des Gebiets; dieses Gebirge ist reich an ausgedehnten Weide- und Wiesenflächen, Karstreliefformen (Dolinen, Buchten, Gruben), kürzeren Flussläufen (Štitarica, Bistrica) und zahlreichen Quellen. Durch die Unterstellung von Sinjajevina als regionaler Naturpark würde eine Art ökologischer Korridor von Schutzgebieten (NP "Durmitor" – RP "Sinjajevina" auf dem Territorium der Gemeinde) gebildet, der die potenziellen natürlichen Werte dieser Gebiete angemessen bewerten und verwalten würde, um eine nachhaltige Entwicklung dieser Gebirgssysteme zu erreichen.